政府自九十一年開始，陸續推動九項國家型前瞻科技計畫，累計已投入五八二億元，期望能促進民間投資，並提昇國內研發水準。但多年來，在九項產業中，只有電信業的民間投資超過政府投入的預算，而九項計畫的權利金收入僅一三億元，投資報酬率低到「驚人」。
不願具名的大學教授表示，用最簡單的「投入與產出」的概念，來看權利金占投入經費比重，嚴重地不成比例，顯示國家型計畫的設計有很大的問題，健全的基礎科學研究，最終目的在產出科學技術，不是埋首研究。
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國科會表示，當初推動國家型科技計畫的目的，是在發展前瞻性產業目的，結合科技研發的上中下游資源，以提升研發成果。膺選為國家型科技計畫的九項科技產業，包括電信、奈米、晶片系統、基因體、農業生技、生技製藥、防災、數位典藏、數位學習等。
據立法院預算中心報告，自九十一年以來，政府對國家型科技計畫，累計已投入五八二億元，九十七年度核定的預算為一一二億元，較九十六年的預算數微減○•一％，估計至九十九年以前，政府還須投入二四五億元，顯示政府對國家型計畫的重視。
不過，預算的投入並沒有同等反映在專利及權利金的成長。立法院預算中心統計，截至二○○七年六月底，九項國家型計畫獲得權利金的金額為一三•二億元，僅佔已投入經費的二•二七％...
高投入，低回收的相似狀況，也發生在國科會所屬的研究單位。以國家奈米元件實驗室為例，一九八八年成立後，二○○一年擴充新建一萬坪的新實驗室，目的是建立世界級奈米元件及材料研究環境，將現有實驗能量提升二倍以上。 8 j- B4 t9 h9 ~. _' F
但根據資料顯示，從二○○二年到二○○七年六月底，該實驗室取得專利七二件，但尚未有專利技轉的記錄，僅有一家業者願意以IC設計分析軟體來交換，以嚐試技術的可行性。 + [( \. q2 ^& g( m0 k" h
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此實驗室所產生的專利，多屬於六吋晶圓製程的方法性技術，與鄰近竹科半導體業者在八吋、一二吋，強調IC製造的量產型製程，在專利需求上出現很大的差異，導致雖然有專利，但在協助產業發展上，卻無用武之地。
業者抱怨，許多學術研究機構，都設有遠大目標，如「領先業界五到十年的前瞻技術」，但是多年來卻未在產業界發生明顯的效益，所以業界只好不斷向外購買國外技術。
一位IC設計業智財主管指出，國科會的學術研究單位，在基礎研究及技術應用的結構比重，應該有調整的必要，以提升基礎研究的比重與品質，因為這些是業界不太可能去做，需要政府做後盾，增加在應用技術與產業的關連度，讓產學有所互動，才不會做出與產業無關的研究，乏人問津、束之高閣。
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科技競爭力 不進反退...
竹科一家IC設計業智財主管表示，平心而論，現在的技術輸出入落差，歸因於早年國際大廠早早佈局技術、訂出規格，不能歸咎於國內學術研究單位的能量不足；但是如果十年後，台灣還不能在專利佈局及前瞻性的產業技術，有所突破，那政府投入那麼多經費，就真的白費納稅人的錢。
國科會副主委楊弘敦表示，國家型計畫是強調產官學研一起加入，每項計畫的時程及分期都不一樣，在基礎環境、技術應用開發的時程也都不一樣，研發不是現在講，下個月就會立即見到成果，也許以前做得不夠好，但是未來調整方向，將更強調產學結合，共同創新，以提升競爭力... {/ m8 s! ~) U3 U9 t- N6 n
楊弘敦表示，通常業者在意的是未來二、三年會產業化的技術，而不太在乎未來一○年要發展的前瞻技術，業者卻一下子要國科會提高基礎研究比重，一下子又說與產業結合不深，「這不是自相矛盾嗎？」
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楊弘敦說，國科會對產業界的反應會參考調整，尤其是中小企業不像大企業設有研發部門，未來在產學合作，將加強與中小企業協助技轉，擴散研究能量，並設下技轉金三年成長二倍的目標，多管齊下增加學術單位結合產業界，及提升競爭力的誘因。
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為此，國科會將與教育部將進行法規結構調整，由教育部評鑑機制，及著手調整大學教授升等辦法，作為配套措施。也就是以往教授只要發表論文數到一定量，就可以升等，未來將加入論文被引用、專利核准數，及廠商技轉回饋金的額度，共同評量。讓學術機構產生的專利，可讓廠商願意付錢技轉。
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